Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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