Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9CQC3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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