Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms