Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nsmce3Q9CPR8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms