Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms