Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GpnmbQ99P91 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms