Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms