Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms