Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms