Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp16Q99LG0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms