Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms