Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms