Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc30a1Q99J38 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ttc30a1Q99J38 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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