Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Smim11aQ99J19 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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