Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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