Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc39cQ8VE09 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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