Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms