Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms