Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms