Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mtmr3Q8K296 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mtmr3Q8K296 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mtmr3Q8K296 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mtmr3Q8K296 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mtmr3Q8K296 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mtmr3Q8K296 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mtmr3Q8K296 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mtmr3Q8K296 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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