Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms