Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms