Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms