Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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