Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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