Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atg4aQ8C9S8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atg4aQ8C9S8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atg4aQ8C9S8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4aQ8C9S8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atg4aQ8C9S8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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