Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms