Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms