Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem87bQ8BKU8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms