Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ttc28Q80XJ3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc28Q80XJ3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms