Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vtcn1Q7TSP5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vtcn1Q7TSP5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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