Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc2bQ7TPM1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms