Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp3Q7TNH6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms