Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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Shq1Q7TMX5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Shq1Q7TMX5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Shq1Q7TMX5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Shq1Q7TMX5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Shq1Q7TMX5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shq1Q7TMX5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Shq1Q7TMX5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms