Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rph3alQ768S4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rph3alQ768S4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rph3alQ768S4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rph3alQ768S4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rph3alQ768S4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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