Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms