Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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