Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mfsd13aQ6PDE8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms