Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BcanQ61361 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BcanQ61361 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BcanQ61361 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BcanQ61361 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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BcanQ61361 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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BcanQ61361 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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BcanQ61361 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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BcanQ61361 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BcanQ61361 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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BcanQ61361 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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BcanQ61361 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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BcanQ61361 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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