Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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