Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Grik1Q60934 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Grik1Q60934 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Grik1Q60934 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Grik1Q60934 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Grik1Q60934 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik1Q60934 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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