Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Slc6a4Q60857 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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