Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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