Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnk2a1Q60737 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms