Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms