Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Foxd4Q60688 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms