Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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