Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms