Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mdc1Q5PSV9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms