Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms